عرض بسيط للتسجيلة

المؤلفAlSaad, Rawan
المؤلفMalluhi, Qutaibah
المؤلفAbouelhoda, Mohamed
تاريخ الإتاحة2024-07-17T07:14:47Z
تاريخ النشر2012
اسم المنشور2012 Cairo International Biomedical Engineering Conference, CIBEC 2012
المصدرScopus
المعرّفhttp://dx.doi.org/10.1109/CIBEC.2012.6473312
معرّف المصادر الموحدhttp://hdl.handle.net/10576/56762
الملخصThis paper presents a methodology for running NGS read mapping tools in the cloud environment based on the MapReduce programming paradigm. As a demonstration, the recently developed and robust sequence alignment tool, BFAST, is used within our methodology to handle massive datasets. The results of our experiments show that the transformation of existing read mapping tools to run within the MapReduce framework dramatically reduces the total execution time and enables the user to utilize the resources provided by the cloud.
اللغةen
الناشرInstitute of Electrical and Electronics Engineers Inc.
الموضوعbioinformatics
Cloud computing
MapReduce
sequence alignment
العنوانEfficient alignment of next generation sequencing data using MapReduce on the cloud
النوعConference Paper
الصفحات18-22
dc.accessType Abstract Only


الملفات في هذه التسجيلة

الملفاتالحجمالصيغةالعرض

لا توجد ملفات لها صلة بهذه التسجيلة.

هذه التسجيلة تظهر في المجموعات التالية

عرض بسيط للتسجيلة