• English
    • العربية
  • English
  • تسجيل الدخول
  • جامعة قطر
  • مكتبة جامعة قطر
  •  الصفحة الرئيسية
  • الوحدات والمجموعات
عرض التسجيلة 
  •   مركز المجموعات الرقمية لجامعة قطر
  • المستودع الرقمي لجامعة قطر
  • أكاديمية
  • مراكز البحث
  • مركز العلوم البيئية
  • مجموعة علوم الغلاف الجوي
  • عرض التسجيلة
  • مركز المجموعات الرقمية لجامعة قطر
  • المستودع الرقمي لجامعة قطر
  • أكاديمية
  • مراكز البحث
  • مركز العلوم البيئية
  • مجموعة علوم الغلاف الجوي
  • عرض التسجيلة
  •      
  •  
    JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

    Transcriptome assembly and abiotic related gene expression analysis of date palm reveal candidate genes involved in response to cadmium stress

    Thumbnail
    عرض / فتح
    اصدار الناشر (بإمكانك الوصول وعرض الوثيقة / التسجيلةمتاح للجميع Icon)
    اصدار الناشر (تحقق من خيارات الوصول)
    تحقق من خيارات الوصول
    التاريخ
    2019
    المؤلف
    Rekik I.
    Chaâbene Z.
    Kriaa W.
    Rorat A.
    Franck V.
    Hafedh M.
    Elleuch A.
    ...show more authors ...show less authors
    البيانات الوصفية
    عرض كامل للتسجيلة
    الملخص
    Date palm in Tunisia is of major economic importance but are also factors of social, environmental and economic stability. An annotated assembly of the transcriptome of cultivar Deglet Nour was reported. RNA was isolated from plant Cd-contaminated leaves, and 37,049 unique Illumina RNA-seq reads were used in a transcriptome assembly. The draft transcriptome assembly consists of 6789 contigs and 17.285 singletons with a means length of 858 bp and 1.042 bp, respectively. The final assembly was functionally annotated using Blast2GO software, allowing the identification of putative genes controlling important agronomic traits. The annotated transcriptome data sets were used to query all known Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes pathways. The most represented molecular functions and biological processes were nucleotide binding and transcription, transport and response to stress and abiotic and biotic stimuli. A prediction of the genes interaction network was proposed by selecting corresponding functionally similar genes from Arabidopsis datasets, downloaded by GeneMANIA version 2.1. Several Cd-responsive genes expression was monitored in in vitro isolated explant of Cd stressed Deglet Nour. Some chelators encoding genes were upregulated confirming in silico findings. Genes encoding HMs transporters in date palm showed expression enhancement more pronounced after 20 days of exposure. P. dactylifera transcriptome provides a valuable resource for future functional analysis of candidate genes involved in metal stress response. - 2019 Elsevier Inc.
    DOI/handle
    http://dx.doi.org/10.1016/j.cbpc.2019.108569
    http://hdl.handle.net/10576/13806
    المجموعات
    • مجموعة علوم الغلاف الجوي [‎38‎ items ]

    entitlement


    مركز المجموعات الرقمية لجامعة قطر هو مكتبة رقمية تديرها مكتبة جامعة قطر بدعم من إدارة تقنية المعلومات

    اتصل بنا | ارسل ملاحظاتك
    اتصل بنا | ارسل ملاحظاتك | جامعة قطر

     

     

    الصفحة الرئيسية

    أرسل عملك التابع لجامعة قطر

    تصفح

    محتويات مركز المجموعات الرقمية
      الوحدات والمجموعات تاريخ النشر المؤلف العناوين الموضوع النوع اللغة الناشر
    هذه المجموعة
      تاريخ النشر المؤلف العناوين الموضوع النوع اللغة الناشر

    حسابي

    تسجيل الدخول

    إحصائيات

    عرض إحصائيات الاستخدام

    مركز المجموعات الرقمية لجامعة قطر هو مكتبة رقمية تديرها مكتبة جامعة قطر بدعم من إدارة تقنية المعلومات

    اتصل بنا | ارسل ملاحظاتك
    اتصل بنا | ارسل ملاحظاتك | جامعة قطر

     

     

    Video