• English
    • العربية
  • English
  • تسجيل الدخول
  • جامعة قطر
  • مكتبة جامعة قطر
  •  الصفحة الرئيسية
  • الوحدات والمجموعات
  • المساعدة
    • إرسال الأعمال الأكاديمية
    • سياسات الناشر
    • أدلة المستخدم
    • الأسئلة الأكثر تكراراً
  • عن المستودع الرقمي
    • الرؤية والرسالة
عرض التسجيلة 
  •   مركز المجموعات الرقمية لجامعة قطر
  • المستودع الرقمي لجامعة قطر
  • أكاديمية
  • مساهمة أعضاء هيئة التدريس
  • كلية العلوم الصحية
  • العلوم الحيوية الطبية
  • عرض التسجيلة
  • مركز المجموعات الرقمية لجامعة قطر
  • المستودع الرقمي لجامعة قطر
  • أكاديمية
  • مساهمة أعضاء هيئة التدريس
  • كلية العلوم الصحية
  • العلوم الحيوية الطبية
  • عرض التسجيلة
  •      
  •  
    JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

    A computational approach for investigating the mutational landscape of RAC-alpha serine/threonine-protein kinase (AKT1) and screening inhibitors against the oncogenic E17K mutation causing breast cancer.

    Thumbnail
    عرض / فتح
    اصدار الناشر (بإمكانك الوصول وعرض الوثيقة / التسجيلةمتاح للجميع Icon)
    اصدار الناشر (تحقق من خيارات الوصول)
    تحقق من خيارات الوصول
    التاريخ
    2019-10-01
    المؤلف
    Thirumal Kumar, D
    Jain, Nikita
    Evangeline, Judith
    Kamaraj, Balu
    Siva, R
    Zayed, Hatem
    George Priya Doss, C
    ...show more authors ...show less authors
    البيانات الوصفية
    عرض كامل للتسجيلة
    الملخص
    Breast cancer (BC) is the most commonly diagnosed cancer among females worldwide, and among the BC-associated mutations in various proteins, mutations in the RAC-alpha serine/threonine-protein kinase (AKT1) remain the most dominant. We thus attempted to understand the potential molecular pathogenicity profile of the mutations in AKT1 using a comprehensive computational protocol involving analyses of biochemistry-disruption and destabilizing properties and conservation. Our predictions revealed that E17K, R67W, V164G, E319G, R391G, D32Y, L52H, L52R, and W80R were the most pathogenic mutations. In addition, the change of glutamate to lysine at position 17 of AKT1 (E17K) was found to be highly predominant. An extensive two-step molecular dynamics (simple and complex) simulation (MDS) using GROMACS (GROningen MAchine for Chemical Simulations) was then initiated to analyze and understand the structural impact of the E17K mutation on the function of AKT1. The simple MDS analysis revealed that the E17K mutation decreases the compactness and intramolecular hydrogen bonds of the protein. We also performed a virtual screening analysis with 19 AKT inhibitors obtained from the Selleck Chemicals website those satisfied the Lipinski rule of 5. Among these 19 compounds, Akti-1/2 exhibited the best binding affinity with both native AKT1 and the E17K mutant. The molecular interaction study also revealed that the co-crystallized AKT1 inhibitor N-(4-(5-(3-acetamidophenyl)-2-(2-aminopyridin-3-yl)-3H-imidazo [4,5-b]pyridin-3-yl)benzyl)-3-fluorobenzamide (12j) exhibited a better interaction with native AKT1 compared with the E17K mutant AKT1 protein, whereas, Akti-1/2 exhibited the opposite effects, i.e., a better interaction with the E17K mutant AKT1 than the native AKT1. These findings from the interaction analysis were further supported by the complex MDS, which measured the compactness and intermolecular hydrogen bonds of the proteins. The results obtained in this study suggest that Akti-1/2 might be a better inhibitor for the treatment of BC caused by the E17K mutation in AKT1.
    DOI/handle
    http://dx.doi.org/10.1016/j.compbiomed.2019.103513
    http://hdl.handle.net/10576/12317
    المجموعات
    • العلوم الحيوية الطبية [‎833‎ items ]

    entitlement


    مركز المجموعات الرقمية لجامعة قطر هو مكتبة رقمية تديرها مكتبة جامعة قطر بدعم من إدارة تقنية المعلومات

    اتصل بنا | ارسل ملاحظاتك
    اتصل بنا | ارسل ملاحظاتك | جامعة قطر

     

     

    الصفحة الرئيسية

    أرسل عملك التابع لجامعة قطر

    تصفح

    محتويات مركز المجموعات الرقمية
      الوحدات والمجموعات تاريخ النشر المؤلف العناوين الموضوع النوع اللغة الناشر
    هذه المجموعة
      تاريخ النشر المؤلف العناوين الموضوع النوع اللغة الناشر

    حسابي

    تسجيل الدخول

    إحصائيات

    عرض إحصائيات الاستخدام

    عن المستودع الرقمي

    الرؤية والرسالة

    المساعدة

    إرسال الأعمال الأكاديميةسياسات الناشرأدلة المستخدمالأسئلة الأكثر تكراراً

    مركز المجموعات الرقمية لجامعة قطر هو مكتبة رقمية تديرها مكتبة جامعة قطر بدعم من إدارة تقنية المعلومات

    اتصل بنا | ارسل ملاحظاتك
    اتصل بنا | ارسل ملاحظاتك | جامعة قطر

     

     

    Video