• English
    • العربية
  • English
  • تسجيل الدخول
  • جامعة قطر
  • مكتبة جامعة قطر
  •  الصفحة الرئيسية
  • الوحدات والمجموعات
  • المساعدة
    • إرسال الأعمال الأكاديمية
    • سياسات الناشر
    • أدلة المستخدم
    • الأسئلة الأكثر تكراراً
  • عن المستودع الرقمي
    • الرؤية والرسالة
عرض التسجيلة 
  •   مركز المجموعات الرقمية لجامعة قطر
  • المستودع الرقمي لجامعة قطر
  • أكاديمية
  • مساهمة أعضاء هيئة التدريس
  • كلية الطب
  • أبحاث الطب
  • عرض التسجيلة
  • مركز المجموعات الرقمية لجامعة قطر
  • المستودع الرقمي لجامعة قطر
  • أكاديمية
  • مساهمة أعضاء هيئة التدريس
  • كلية الطب
  • أبحاث الطب
  • عرض التسجيلة
  •      
  •  
    JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

    A landscape of genomic alterations at the root of a near-untreatable tuberculosis epidemic.

    Thumbnail
    عرض / فتح
    BMC Medicine.pdf (1.390Mb)
    التاريخ
    2020-02-01
    المؤلف
    Klopper, Marisa
    Heupink, Tim Hermanus
    Hill-Cawthorne, Grant
    Streicher, Elizabeth Maria
    Dippenaar, Anzaan
    de Vos, Margaretha
    Abdallah, Abdallah Musa
    Limberis, Jason
    Merker, Matthias
    Burns, Scott
    Niemann, Stefan
    Dheda, Keertan
    Posey, James
    Pain, Arnab
    Warren, Robin Mark
    ...show more authors ...show less authors
    البيانات الوصفية
    عرض كامل للتسجيلة
    الملخص
    Atypical Beijing genotype Mycobacterium tuberculosis strains are widespread in South Africa and have acquired resistance to up to 13 drugs on multiple occasions. It is puzzling that these strains have retained fitness and transmissibility despite the potential fitness cost associated with drug resistance mutations. We conducted Illumina sequencing of 211 Beijing genotype M. tuberculosis isolates to facilitate the detection of genomic features that may promote acquisition of drug resistance and restore fitness in highly resistant atypical Beijing forms. Phylogenetic and comparative genomic analysis was done to determine changes that are unique to the resistant strains that also transmit well. Minimum inhibitory concentration (MIC) determination for streptomycin and bedaquiline was done for a limited number of isolates to demonstrate a difference in MIC between isolates with and without certain variants. Phylogenetic analysis confirmed that two clades of atypical Beijing strains have independently developed resistance to virtually all the potent drugs included in standard (pre-bedaquiline) drug-resistant TB treatment regimens. We show that undetected drug resistance in a progenitor strain was likely instrumental in this resistance acquisition. In this cohort, ethionamide (ethA A381P) resistance would be missed in first-line drug-susceptible isolates, and streptomycin (gidB L79S) resistance may be missed due to an MIC close to the critical concentration. Subsequent inadequate treatment historically led to amplification of resistance and facilitated spread of the strains. Bedaquiline resistance was found in a small number of isolates, despite lack of exposure to the drug. The highly resistant clades also carry inhA promoter mutations, which arose after ethA and katG mutations. In these isolates, inhA promoter mutations do not alter drug resistance, suggesting a possible alternative role. The presence of the ethA mutation in otherwise susceptible isolates from ethionamide-naïve patients demonstrates that known exposure is not an adequate indicator of drug susceptibility. Similarly, it is demonstrated that bedaquiline resistance can occur without exposure to the drug. Inappropriate treatment regimens, due to missed resistance, leads to amplification of resistance, and transmission. We put these results into the context of current WHO treatment regimens, underscoring the risks of treatment without knowledge of the full drug resistance profile.
    DOI/handle
    http://dx.doi.org/10.1186/s12916-019-1487-2
    http://hdl.handle.net/10576/13757
    المجموعات
    • أبحاث الطب [‎1819‎ items ]

    entitlement


    مركز المجموعات الرقمية لجامعة قطر هو مكتبة رقمية تديرها مكتبة جامعة قطر بدعم من إدارة تقنية المعلومات

    اتصل بنا | ارسل ملاحظاتك
    اتصل بنا | ارسل ملاحظاتك | جامعة قطر

     

     

    الصفحة الرئيسية

    أرسل عملك التابع لجامعة قطر

    تصفح

    محتويات مركز المجموعات الرقمية
      الوحدات والمجموعات تاريخ النشر المؤلف العناوين الموضوع النوع اللغة الناشر
    هذه المجموعة
      تاريخ النشر المؤلف العناوين الموضوع النوع اللغة الناشر

    حسابي

    تسجيل الدخول

    إحصائيات

    عرض إحصائيات الاستخدام

    عن المستودع الرقمي

    الرؤية والرسالة

    المساعدة

    إرسال الأعمال الأكاديميةسياسات الناشرأدلة المستخدمالأسئلة الأكثر تكراراً

    مركز المجموعات الرقمية لجامعة قطر هو مكتبة رقمية تديرها مكتبة جامعة قطر بدعم من إدارة تقنية المعلومات

    اتصل بنا | ارسل ملاحظاتك
    اتصل بنا | ارسل ملاحظاتك | جامعة قطر

     

     

    Video